Создание впервые подробного анатомо-физиологического описания организма человека было качественно новым в развитии медицины. Гален - внедрял в основу врачевания и решения задач медицины фундаментальные дисциплины (анатомию и физиологию), поэтому его справедливо считают основоположником научной медицины (Б. Д. Петров)
Принципами научного исследования для него были: «Тот, кто хочет созерцать создания природы, не должен доверяться трудам по анатомии, а должен полагаться на свои глаза» И далее: «Необходимо точно знать функции прежде всего строение каждой части, рассматривая факты, открываемые анатомированием на основании собственных наблюдений; ведь теперь книги тех, которые называк себя анатомами, изобилуют тысячами ошибок. В этом не трудно увидеть принцип современного естествознания — Nullius in verbd - отрицание правомерности ссылок на авторитет для доказательств. В полемике с Асклепиадом, противником гуморальной теории, он указывает на ошибки последнего: «Одна — пренебрежением к анатомическим вскрытиям, другая — незнанием принципов логического мышления».
В трудах Галена трактовка явлений природы исключительно телеологическая, например, « .во всем наш демиург при устройстве частей преследует одну только цель: выбор лучшего». Тезис о том, что «природа разумна» не только затрудняет усвоение его открытий, но и .противоречит современному естествознанию. В специальных исследованиях Галена обнаруживается немало неточностей, а иногда грубых ошибок. Например, он считал, что, пульсирующая сила артерий является главным двигателем крови по сосудам, хотя он же описал систолу и диастолу сердца; эта идея не так давно частично возродилась в теории «периферического сердца» М. В. Яновского. Наиболее примечательным было ошибочное представление о том, что переход крови из правого желудочка в левый происходит через межжелудочковую перегородку. Только в XVII веке труды Галена позволили исправить эту ошибку.
Гален — последователь высокой врачебной этики в духе Гиппократа — не мог равнодушно видеть падение морали многих целителей Рима: «Ум большинства врачей направлен не на науку, не на полезные рецепты; низкое корыстолюбие делает их способными на всякий постылый поступок (шантаж). Между разбойниками и врачами вся разница в том, что одни совершают свои преступления в горах, а другие в Риме». Он убежден, что «ни одному хорошему человеку не свойственна зависть к чему-либо, но он создан, чтобы всему помогать и все улучшать». Заканчивая книгу «О назначении частей человеческого тела», Гален писал, что «врач извлечет очень большую пользу для лечения из этой работы, так же как и из работы о функциях». Таким образом, в конце античного пе-эиода начали довольно основательно изучать подробности» организма человека, но к патологической анатомии еще не подошли.
Гален, требовавший изучать все «своими глазами», избегать чужих писаний и авторитетов, по иронии судьбы сам стал самым авторитетным ученым в истории медицины. Он был непререкаем в течение 14 столетий. Часто считали, что скорее природа может ошибиться, чем Гален. Его книги (и его ошибки!) были канонизированы, как и священные книги церкви и труды древних авторов.
