Классическая гомеопатия в том виде, как она практикуется настоящее время большинством врачей, сформировалась в конце 20-х годов 19-го века. Эти годы представляют собой эпоху водораздела в становлении гомеопатии, знаменуя собой начало наиболее плодотворного периода в Деятельности Ганемана. В 1828 году вышло в свет первое издание книги «Хронические болезни, их своеобразие и гомеопатическое лечение». В книге содержались новые материалы, посвященные патогенезу хронических заболеваний, Маteria Меdiса и указания по работе с отдельными случаями заболевания. Вслед за «Хроническими болезнями» вышло в свет 4-e издание «Органона», в котором автор подробнее разъяснил основные положения гомеопатии, процедуры работы с пациентами и методологические вопросы.

В этих фундаментальных трудах Ганеман сформулировал теорию жизненной силы, учение о хронических миазмах и о лишенной материальности 30С-потенции. Учитель подробно останавливается в своих текстах на нашей духовной природе и динамике жизненной силы, отказываясь тем самым от учения ортодоксальных школ tolle саusum (однонаправленности причинно-следственных связей) и materia peccans (материалистической основе заболевания). В предложенной им новой системе врачевания в качестве руководства к подбору целебных средств используются наряду со знаками и симптомами психологические и конституциональные факторы, а также полная этиология заболевания.