Везалий так же описывает мышцы глаза, мышцы яичек и матки, мышцы языка, мышцы прямой кишки заднего прохода, обьединяя это все в разделе описания мышц всего организма.

В главе вивисекции Везалий описывает экспериментальный пневмоторакс.

Много Везалий уделял изучению сосудов. Он правильно описал сосуды легких, так же сосуды других органов. Он пишет: « Артерия- сосуд перепончатый, подобно вене, округлый и полый, как трубка; по нему изливаются по всему телу жизненный дух и стремительно несущаяся горячая кровь, с помощью коих, с присоединением движения самой артерии (кое состоит в расширении и сжатии), подогреваются естественная теплота и жизненный дух». Во времена Гиппократа, Платония и Аристотеля артерия называлась трубка, через которую вдыхался воздух и выдыхался.

Трактат Везалия украшен многочисленными таблицами, гравюрами, резанными по дереву и оригинальными заглавными буквами.

Труды Везалия издавались в Базеле под редакцией Иоанна Опорина. Везалия, по всей видимости, привлекала слава Базеля - литературного центра Европы того времени и не только, Везалия привлекало издание Опорина потому, что он был знаком с медициной и знал языки, которыми в трактате пользовался Везалий. Большинство прославленных сочинений того времени было издано базельскими печатниками.

Во время своего пребывания в Базеле Везалий собственноручно приготовил из тела одного казненного скелет, который сохраняется в анатомическом музее до нашего времени.

После выхода в свет великого труда, Сильвий и его ученики выступили против Везалия. Сильвий называл его «Vesanus», что обозначает «безумный», и издал памфлет- «Опровержение клевет некого безумца на анатомию Гиппократа и Галена, составленные Яковом Сильвием королевским толкователем по медицинским вопросам в Париже» 1555г.

Сильвий в этом памфлете отрекся от своего бывшего ученика и друга. Сильвий называл Везалия перед лицом всего ученого мира «клеветником». Памфлет сыграл роковую роль в жизни Везалия, приведя к тому, что Везалий ушел с кафедры, а так же к изгнанию и преждевременной гибели Везалия на острове Занте.

Борьба сломила Везалия. В порыве отчаяния он сжег многие свои труды, прекратил преподавание. Он согласился занять пост придворного врача короля, изучил много лекарственных средств, написал труды по хирургии и трактат «О китайском корне». Везалий пытался так же заниматься научными работами, но гнет инквизиции не дали возможности.

Вскоре Везалий уезжает из страны, во время шторма Везалий погибает не далеко от острова Занте.